铜是生命所必需的微量元素之一，正常人体中含铜量约为100—150 mg。人体中铜大都存在于肝脏和中枢神经系统，对人体造血，细胞生长、某些酶的活动及内分泌腺功能有重要作用，但摄入过量，则会刺激消化系统，引起腹痛、呕吐。人的口服致死量约为10克。 
铜对低等生物和农作物毒性较大，其质量浓度达0.1—0.2mg／L即可使鱼类致死，与锌共存时毒性可以增加，对贝类水生生物毒性更大，一般水产用水要求铜的质量浓度在0．0lmg/L以下。对于农作物，铜是重金属中毒性较高者，植物吸收铜离子后，固定于根部皮层，影响养分吸收。灌溉水中含铜较高时，即在土壤和作物中积累，可使农作物枯死。铜对水体自净作用有较严重的影响，当其质量浓度为0.001mg／L时，即有轻微抑制作用，质量浓度为0.0lmg／L时，有明显抑制作用。